Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TGM4P49221 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TGM4P49221 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TGM4P49221 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TGM4P49221 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms