Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RCVRNP35243 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCVRNP35243 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms