Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJA4P35212 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJA4P35212 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms