Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTX2P32243 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTX2P32243 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTX2P32243 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms