Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HOXA6P31267 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms