Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CMPK1P30085 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms