Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GTF2E2P29084 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2E2P29084 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms