Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2E1P29083 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms