Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
DNMT1P26358 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms