Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP2B4P23634 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2B4P23634 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms