Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRBP23467 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRBP23467 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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