Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIG1P18858 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIG1P18858 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIG1P18858 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms