Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNA6P17658 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNA6P17658 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms