Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAPN2P17655 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAPN2P17655 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms