Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HSPA6P17066 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms