Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EPCAMP16422 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
EPCAMP16422 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms