Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
GTF2F2P13984 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms