Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT13P13646 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT13P13646 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT13P13646 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
KRT13P13646 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRT13P13646 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRT13P13646 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms