Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms