Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
COX6A1P12074 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms