Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCF2P10911 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCF2P10911 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MCF2P10911 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms