Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NGFRP08138 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NGFRP08138 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
NGFRP08138 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NGFRP08138 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms