Protein–RNA interactions for Protein: P05014

IFNA4, Interferon alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA4P05014 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFNA4P05014 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms