Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGAP02671 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGAP02671 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGAP02671 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGAP02671 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGAP02671 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FGAP02671 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms