Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
APOEP02649 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
APOEP02649 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
APOEP02649 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
APOEP02649 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
APOEP02649 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOEP02649 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOEP02649 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOEP02649 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOEP02649 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOEP02649 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms