Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
COL3A1P02461 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COL3A1P02461 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms