Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SYF2O95926 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SYF2O95926 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms