Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC24BO95487 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms