Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms