Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 FNBP4-208ENST00000529156 344 ntTSL 32.29□□□□□ -2.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 NBEAL1-209ENST00000492870 439 ntTSL 32.28□□□□□ -2.043e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 DPY19L1-205ENST00000463538 461 ntTSL 52.23□□□□□ -2.053e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AQR-206ENST00000560117 543 ntTSL 42.21□□□□□ -2.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PIBF1-205ENST00000489922 632 ntTSL 32.2□□□□□ -2.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 GTDC1-213ENST00000467352 792 ntTSL 42.19□□□□□ -2.063e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR1D-214ENST00000636226 100 ntTSL 52.11□□□□□ -2.072e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB38-203ENST00000503809 578 ntTSL 42.08□□□□□ -2.083e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBTB20-219ENST00000491500 559 ntTSL 41.96□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 OAT-204ENST00000476917 646 ntTSL 31.92□□□□□ -2.13e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.113e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 INTS6-210ENST00000483441 2969 ntTSL 21.76□□□□□ -2.133e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 STX8-207ENST00000573881 293 ntTSL 31.7□□□□□ -2.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 AQR-203ENST00000558202 497 ntTSL 21.66□□□□□ -2.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 PIBF1-202ENST00000469712 574 ntTSL 31.66□□□□□ -2.143e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 FANCB-204ENST00000489126 559 ntTSL 21.61□□□□□ -2.153e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 WWC2-210ENST00000515284 641 ntTSL 51.53□□□□□ -2.163e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 RBBP8-206ENST00000577445 480 ntTSL 51.52□□□□□ -2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 MYO1D-214ENST00000584232 590 ntTSL 51.51□□□□□ -2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ENTPD5-205ENST00000556108 451 ntTSL 31.51□□□□□ -2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LRRC69-203ENST00000518304 571 ntTSL 41.49□□□□□ -2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CDK14-211ENST00000460493 436 ntTSL 51.47□□□□□ -2.173e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 LARP4-215ENST00000550260 583 ntTSL 31.05□□□□□ -2.243e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 CRTC2-209ENST00000493909 207 ntTSL 20.63□□□□□ -2.312e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 UBXN4-207ENST00000471246 395 ntTSL 30.62□□□□□ -2.313e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 POLR1D-222ENST00000637389 129 ntTSL 50.2□□□□□ -2.382e-11■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.392e-8■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 SMG1-211ENST00000565324 12465 ntTSL 1 (best)5.37□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 137.9
SF3B1O75533 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 137.8
SF3B1O75533 PTK2B-203ENST00000397501 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 137.8
SF3B1O75533 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 137.8
SF3B1O75533 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 137.8
SF3B1O75533 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.061e-6■■■■■ 137.8
SF3B1O75533 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.861e-6■■■■■ 137.8
SF3B1O75533 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MGRN1-208ENST00000587747 1898 ntTSL 517.96■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MGRN1-204ENST00000536343 1575 ntTSL 217.25■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.843e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-203ENST00000487398 962 ntTSL 522.05■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-212ENST00000625974 918 ntTSL 514.08□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-209ENST00000541717 2363 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-213ENST00000626154 1966 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-204ENST00000489766 551 ntTSL 311.02□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-205ENST00000495529 794 ntTSL 511.02□□□□□ -0.653e-6■■■■■ 137.7
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SF3B1O75533 MELK-214ENST00000627766 2263 ntTSL 510.06□□□□□ -0.83e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 137.7
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SF3B1O75533 MELK-208ENST00000536987 2125 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.23e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.323e-6■■■■■ 137.7
SF3B1O75533 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.513e-6■■■■■ 137.7
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SF3B1O75533 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 MYO18B-203ENST00000418374 6363 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 137.6
SF3B1O75533 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 RPL9-206ENST00000504470 689 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 RPL9-211ENST00000514842 2153 ntTSL 512.35□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 310.06□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 RPL9-208ENST00000508595 667 ntTSL 33.52□□□□□ -1.852e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 43.39□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 137.5
SF3B1O75533 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.098e-7■■■■■ 137.4
SF3B1O75533 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.268e-7■■■■■ 137.4
SF3B1O75533 ANKS6-207ENST00000634393 2284 ntTSL 513.71□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 137.4
SF3B1O75533 SSBP3-214ENST00000533209 552 ntTSL 412.99□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 137.4
SF3B1O75533 MIGA2-203ENST00000439290 4345 ntTSL 213.42□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 137.3
SF3B1O75533 MIGA2-204ENST00000445183 3598 ntTSL 213.22□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 137.3
SF3B1O75533 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 137.3
SF3B1O75533 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-6■■■■■ 137.2
SF3B1O75533 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 137.2
SF3B1O75533 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 137.2
SF3B1O75533 ADAM8-202ENST00000445355 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 137.2
SF3B1O75533 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 137.1
SF3B1O75533 PKD1-201ENST00000262304 14138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 137.1
SF3B1O75533 FBRSL1-206ENST00000542306 1246 ntTSL 522.08■■□□□ 1.133e-10■■■■■ 137
SF3B1O75533 FBRSL1-203ENST00000537804 261 ntTSL 515.25■□□□□ 0.033e-10■■■■■ 137
SF3B1O75533 FBRSL1-202ENST00000536075 208 ntTSL 513.78□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 137
SF3B1O75533 SLC39A11-206ENST00000579491 692 ntTSL 313.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 137
SF3B1O75533 SLC39A11-217ENST00000584129 747 ntTSL 311.5□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 137
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