Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PPLO60437 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PPLO60437 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PPLO60437 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PPLO60437 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PPLO60437 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PPLO60437 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPLO60437 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPLO60437 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPLO60437 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PPLO60437 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PPLO60437 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms