Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CREB3O43889 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CREB3O43889 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CREB3O43889 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CREB3O43889 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CREB3O43889 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CREB3O43889 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB3O43889 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CREB3O43889 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms