Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MEFVO15553 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MEFVO15553 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms