Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FANCAO15360 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCAO15360 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCAO15360 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCAO15360 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCAO15360 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCAO15360 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
FANCAO15360 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
FANCAO15360 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
FANCAO15360 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FANCAO15360 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FANCAO15360 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms