Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNMO15061 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNMO15061 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNMO15061 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNMO15061 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNMO15061 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYNMO15061 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYNMO15061 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYNMO15061 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms