Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA3EO15041 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms