Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMBP2O15034 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms