Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APAF1O14727 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APAF1O14727 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APAF1O14727 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APAF1O14727 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms