Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOC4-APOC2K7ER74 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms