Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms