Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
GGTLC3B5MD39 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms