Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZK1P1A8MUH7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZK1P1A8MUH7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDZK1P1A8MUH7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms