Protein–RNA interactions for Protein: A6NK97

SLC22A20, Solute carrier family 22 member 20, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A20A6NK97 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC22A20A6NK97 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC22A20A6NK97 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms