Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
POTEMA6NI47 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms