Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP17L4A6NCW7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms