Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFCAB5A4FU69 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFCAB5A4FU69 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFCAB5A4FU69 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFCAB5A4FU69 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFCAB5A4FU69 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
EFCAB5A4FU69 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms