Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A0A0U1RQF3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms