Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC4A4Q9Y6R1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms