Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBE2J1Q9Y385 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBE2J1Q9Y385 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms