Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
THRAP3Q9Y2W1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THRAP3Q9Y2W1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms